MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus toyonensis BCT-7112 plasmid pBCT8

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022783	TGAAA	2	10	56	65	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022783	A	6	6	63	68	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022783	AT	3	6	110	115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022783	TTA	2	6	133	138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022783	ATTAA	2	10	167	176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022783	ATTA	2	8	197	204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022783	AT	3	6	210	215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022783	A	6	6	242	247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022783	TTTA	2	8	315	322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022783	TTA	2	6	328	333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022783	A	6	6	338	343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022783	CTA	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022783	TAA	2	6	385	390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022783	TA	3	6	453	458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022783	TTATT	2	10	479	488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022783	A	7	7	495	501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022783	TAA	2	6	506	511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022783	A	6	6	528	533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022783	ACA	2	6	575	580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022783	TTTTAT	2	12	616	627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022783	ATA	2	6	638	643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022783	TA	3	6	642	647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022783	ATA	3	9	645	653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022783	AT	3	6	657	662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022783	ATT	2	6	705	710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624505
26	NC_022783	TAT	2	6	716	721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624505
27	NC_022783	GTATAT	2	12	734	745	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	557624505
28	NC_022783	T	9	9	747	755	0 %	100 %	0 %	0 %	557624505
29	NC_022783	ATAAA	2	10	770	779	80 %	20 %	0 %	0 %	557624505
30	NC_022783	A	6	6	867	872	100 %	0 %	0 %	0 %	557624505
31	NC_022783	AAC	2	6	915	920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624505
32	NC_022783	A	8	8	928	935	100 %	0 %	0 %	0 %	557624505
33	NC_022783	TAT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624505
34	NC_022783	ATA	2	6	989	994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624505
35	NC_022783	AT	3	6	1053	1058	50 %	50 %	0 %	0 %	557624505
36	NC_022783	CTA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624505
37	NC_022783	ATC	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022783	ACA	2	6	1298	1303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022783	CAA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022783	TAAA	2	8	1356	1363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022783	A	6	6	1385	1390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022783	A	6	6	1392	1397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022783	T	6	6	1413	1418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022783	TTA	2	6	1429	1434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022783	T	6	6	1487	1492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022783	GAATT	2	10	1501	1510	40 %	40 %	20 %	0 %	557624506
47	NC_022783	ATT	2	6	1515	1520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624506
48	NC_022783	AACA	2	8	1543	1550	75 %	0 %	0 %	25 %	557624506
49	NC_022783	AATA	2	8	1567	1574	75 %	25 %	0 %	0 %	557624506
50	NC_022783	TTA	2	6	1601	1606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624506
51	NC_022783	AAAG	2	8	1639	1646	75 %	0 %	25 %	0 %	557624506
52	NC_022783	TCC	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557624506
53	NC_022783	TTA	2	6	1693	1698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624506
54	NC_022783	TCC	2	6	1709	1714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_022783	TA	3	6	1743	1748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022783	T	6	6	1780	1785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022783	ATATT	2	10	1790	1799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022783	TAT	2	6	1885	1890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022783	AAC	2	6	1894	1899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022783	GTT	2	6	1949	1954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022783	CAA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624507
62	NC_022783	GAA	2	6	2028	2033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557624507
63	NC_022783	A	7	7	2040	2046	100 %	0 %	0 %	0 %	557624507
64	NC_022783	T	6	6	2096	2101	0 %	100 %	0 %	0 %	557624507
65	NC_022783	CAA	2	6	2109	2114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624507
66	NC_022783	CAAA	2	8	2199	2206	75 %	0 %	0 %	25 %	557624507
67	NC_022783	ATT	2	6	2211	2216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624507
68	NC_022783	CTC	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557624507
69	NC_022783	AAG	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557624507
70	NC_022783	AAC	2	6	2270	2275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624507
71	NC_022783	ACA	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624507
72	NC_022783	TAGA	2	8	2332	2339	50 %	25 %	25 %	0 %	557624507
73	NC_022783	TTG	2	6	2341	2346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557624507
74	NC_022783	A	6	6	2370	2375	100 %	0 %	0 %	0 %	557624507
75	NC_022783	GAA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557624507
76	NC_022783	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	557624507
77	NC_022783	CAA	2	6	2529	2534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624507
78	NC_022783	A	7	7	2533	2539	100 %	0 %	0 %	0 %	557624507
79	NC_022783	GTG	2	6	2540	2545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557624507
80	NC_022783	T	6	6	2587	2592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022783	AAT	2	6	2686	2691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022783	AGT	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022783	ATA	2	6	2805	2810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022783	TAT	2	6	2811	2816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022783	GGA	2	6	2848	2853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022783	TAT	2	6	2885	2890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022783	T	7	7	3017	3023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022783	A	8	8	3098	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022783	TAA	2	6	3145	3150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022783	TTATT	2	10	3208	3217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022783	T	6	6	3228	3233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022783	TAA	2	6	3267	3272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624508
93	NC_022783	TCTT	2	8	3273	3280	0 %	75 %	0 %	25 %	557624508
94	NC_022783	A	6	6	3311	3316	100 %	0 %	0 %	0 %	557624508
95	NC_022783	ATA	2	6	3361	3366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624508
96	NC_022783	TTA	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624508
97	NC_022783	TTA	2	6	3422	3427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624508
98	NC_022783	A	6	6	3431	3436	100 %	0 %	0 %	0 %	557624508
99	NC_022783	A	6	6	3460	3465	100 %	0 %	0 %	0 %	557624508
100	NC_022783	ACT	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624508
101	NC_022783	T	8	8	3478	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	557624508
102	NC_022783	CTTAAT	2	12	3486	3497	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	557624508
103	NC_022783	T	8	8	3500	3507	0 %	100 %	0 %	0 %	557624508
104	NC_022783	TCT	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624508
105	NC_022783	TTA	2	6	3524	3529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624508
106	NC_022783	TCA	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624508
107	NC_022783	TA	4	8	3548	3555	50 %	50 %	0 %	0 %	557624508
108	NC_022783	AAT	2	6	3564	3569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624508
109	NC_022783	T	6	6	3638	3643	0 %	100 %	0 %	0 %	557624508
110	NC_022783	GTT	2	6	3683	3688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557624508
111	NC_022783	TAA	2	6	3702	3707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624508
112	NC_022783	AAAT	2	8	3766	3773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022783	ATT	2	6	3828	3833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022783	TCG	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022783	TTG	2	6	3918	3923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022783	CGG	2	6	3948	3953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022783	AAC	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022783	A	6	6	4034	4039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022783	CTTTT	2	10	4078	4087	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_022783	TAC	2	6	4131	4136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022783	TA	4	8	4162	4169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022783	AAAG	2	8	4189	4196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022783	TAA	2	6	4201	4206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022783	A	8	8	4233	4240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022783	TG	3	6	4249	4254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022783	T	9	9	4256	4264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022783	A	6	6	4291	4296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022783	ATAA	2	8	4329	4336	75 %	25 %	0 %	0 %	557624509
129	NC_022783	T	6	6	4351	4356	0 %	100 %	0 %	0 %	557624509
130	NC_022783	AAC	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624509
131	NC_022783	ATA	2	6	4445	4450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624509
132	NC_022783	TCC	2	6	4485	4490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557624509
133	NC_022783	CAT	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624509
134	NC_022783	CTTT	2	8	4533	4540	0 %	75 %	0 %	25 %	557624509
135	NC_022783	CT	4	8	4568	4575	0 %	50 %	0 %	50 %	557624509
136	NC_022783	TGC	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557624509
137	NC_022783	TCATTA	2	12	4631	4642	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	557624509
138	NC_022783	T	7	7	4646	4652	0 %	100 %	0 %	0 %	557624509
139	NC_022783	AAT	2	6	4654	4659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624509
140	NC_022783	AAG	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557624509
141	NC_022783	T	6	6	4795	4800	0 %	100 %	0 %	0 %	557624509
142	NC_022783	T	6	6	4802	4807	0 %	100 %	0 %	0 %	557624509
143	NC_022783	TTC	2	6	4819	4824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624509
144	NC_022783	CTTA	2	8	4837	4844	25 %	50 %	0 %	25 %	557624509
145	NC_022783	TCT	3	9	4868	4876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624509
146	NC_022783	ACC	2	6	4882	4887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557624509
147	NC_022783	TCTT	2	8	4927	4934	0 %	75 %	0 %	25 %	557624509
148	NC_022783	T	7	7	4940	4946	0 %	100 %	0 %	0 %	557624509
149	NC_022783	TC	3	6	4986	4991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022783	GGAA	2	8	4999	5006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022783	TA	3	6	5029	5034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022783	AT	4	8	5037	5044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022783	TTA	2	6	5060	5065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022783	T	6	6	5100	5105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022783	TAA	2	6	5118	5123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022783	AACAT	2	10	5162	5171	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_022783	TA	3	6	5325	5330	50 %	50 %	0 %	0 %	557624510
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186	NC_022783	GATT	2	8	6616	6623	25 %	50 %	25 %	0 %	557624510
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189	NC_022783	ATG	2	6	6702	6707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
190	NC_022783	CAAAA	2	10	6806	6815	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
191	NC_022783	TCAA	2	8	6863	6870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_022783	ATT	2	6	7054	7059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_022783	TTA	2	6	7101	7106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_022783	TA	3	6	7172	7177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_022783	ATT	2	6	7190	7195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.